Новые персонажи:

Барака (Ричард Дивицио): лидер Таркатан, ответственный за атаку на академию Ву Ши.



Джакс Бригс (Джон Парриш): член отряда Специальных Сил США, друг Сонии Блейд, последовавший во Внешний Мир, чтобы спасти её.



Китана (Каталин Замиар): приёмная дочь Шао Кана и его персональная убийца.



Кунг Лао (Антони Маркез): единственный монах Шаолинь, кому удалось выжить после нападения отряда таркатан.



Милена (Каталин Замиар): клон Китаны и персональная убийца Шао Кана.



Вернувшиеся персонажи:

Джонни Кейдж (Даниель Песина): голливудская кинозвезда. Он присоединился к Лью Кангу в его путешествие во Внешний Мир.



Лью Канг (Хо Сунг Пак): шаолиньский монах и Чемпион Священного Турнира. Отправился во Внешний Мир, чтобы отомстить за гибель монахов из своего храма.



Рейден (Карлос Песина): бог Грома, который решает остановить Шао Кана.



Рептилия (Даниель Песина): персональный телохранитель Шанг Сунга.



Скорпион (Даниель Песина): призрак, восставший из Преисподней, чтобы уничтожить Саб-Зиро, который вновь принимает участие в турнире.



Шанг Сунг (доктор Филипп Ан): злой колдун, который уговорил Шао Кана сохранить ему жизнь и вернуть молодость, предложив новый план захвата Земного Царства.



Саб-Зиро (Даниель Песина): младший и более милосердный брат, первого Саб-зиро, посланный Лин Куэй, чтобы завершить миссию своего брата - Шанг Сунга.



Босс и под-босс:

Кинтаро (модель анимированная покадровой съёмкой) - представитель расы Шокан.

 

  Шао Кан (Брайан Глинн, озвучен Стивом Ричи) - Император Внешнего Мира.



Секретные игроки:

Джейд (Каталин Замиар): персональная убийца Шао Кана, близкая подруга Китаны.



Нуб-Сайбот (Даниель Песина): таинственный ниндзя, чья истинная личность будет раскрыта в Mortal Kombat: Deception.



Смоук (Даниель Песина): друг Саб-Зиро и брат по клану Лин Куэй.



Сония Блейд и Кано - единственные бойцы из первой части игры, которые не вернулись, как играбельные бойцы в МК-II. Они появляются на уровне "Арена Кана", прикованные цепями, к подиумам на обозрении зрителей.